Tüpraş, hisseleri Borsa İstanbul'da (BIST) halka açık olarak işlem gören bir anonim şirket olup, sermayesinin büyük bir kısmı Koç Holding iştiraki olan Enerji Yatırımları A.Ş. tarafından kontrol edilmektedir. Şirket yönetiminde ana hissedar konumunda Koç Topluluğu bulunurken, kalan önemli bir hisse oranı ise hem yerli hem de yabancı kurumsal ve bireysel yatırımcıların portföylerinde yer almaktadır. Geçmiş yıllarda ortaklık yapısında yer alan uluslararası enerji devi Shell, hisselerini devrederek ortaklıktan ayrılmış, bunun sonucunda Koç Holding ana hissedarlık yapısını daha da güçlendirmiştir.