Os principais riscos associados ao Banco de Brasília envolvem a concentração de suas operações econômicas na região do Distrito Federal, exposição a ciclos políticos locais e a baixa liquidez de suas ações ordinárias e preferenciais negociadas na bolsa de valores. Adicionalmente, instituições financeiras públicas enfrentam desafios atrelados a diretrizes de governo, eventuais pressões políticas na concessão de crédito direcionado e a necessidade de manter margens saudáveis de rentabilidade frente à concorrência agressiva de grandes bancos privados e fintechs no cenário nacional.