Als Präsident des SNB-Direktoriums beläuft sich das offizielle Jahresgehalt von Martin Schlegel auf circa 1,295 Millionen Franken brutto inklusive Vorsorge- und Sozialleistungen. Damit gehört er zu den bestbezahlten Exponenten im öffentlichen beziehungsweise institutionellen Sektor der Schweiz, wobei die Vergütungsstruktur im Rahmen transparenter nationalbankinterner Reglemente streng überwacht wird.